Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VNN3Q9NY84 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms