Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PNPLA3Q9NST1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms