Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC6A13Q9NSD5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms