Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNNBIP1Q9NSA3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms