Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B1Q9NRF2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms