Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASCL3Q9NQ33 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms