Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VTA1Q9NP79 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTA1Q9NP79 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms