Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRHQ9HD43 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRHQ9HD43 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms