Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGNBP2Q9H3C7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGNBP2Q9H3C7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms