Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNPKQ9C0E8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms