Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZC3H12CQ9C0D7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms