Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms