Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP5Q9BXF6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms