Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C1orf50Q9BV19 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf50Q9BV19 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf50Q9BV19 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf50Q9BV19 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf50Q9BV19 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf50Q9BV19 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf50Q9BV19 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf50Q9BV19 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf50Q9BV19 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf50Q9BV19 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf50Q9BV19 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C1orf50Q9BV19 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms