Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UTP23Q9BRU9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms