Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3CQ99985 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms