Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3R4Q99570 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms