Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFDN5Q99471 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms