Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RSF1Q96T23 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RSF1Q96T23 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms