Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms