Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CICQ96RK0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms