Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms