Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF48Q96MX3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF48Q96MX3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms