Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms