Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227BQ96M60 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227BQ96M60 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms