Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms