Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms