Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG3Q96JB2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms