Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED3Q96IU2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
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