Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP4CQ96CF2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms