Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF516Q92618 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF516Q92618 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms