Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMPDL3AQ92484 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms