Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RAPGEF4Q8WZA2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAPGEF4Q8WZA2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms