Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNKSR2Q8WXI2 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms