Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC21AQ8NDW8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
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