Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms