Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD1Q8NA66 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms