Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF1Q8N6C5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF1Q8N6C5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms