Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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