Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC103Q8IW40 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms