Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC6Q8IVU3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC6Q8IVU3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms