Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP54Q7Z3B4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms