Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMUB2Q71RG4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms