Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C12orf54Q6X4T0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms