Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms