Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC4Q6P2E9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms