Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms