Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms