Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms