Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms